رویکردی جدید در انتخاب کاندیدا های دارویی ضد سرطان مبتنی بر روشهای کمومتریکس از قبیل آنالیزهای QSAR/QSPR
رویکردی جدید در انتخاب کاندیدا های دارویی ضد سرطان مبتنی بر روشهای کمومتریکس از قبیل آنالیزهای QSAR/QSPR
رویکردی جدید در انتخاب کاندیدا های دارویی ضد سرطان مبتنی بر روشهای کمومتریکس از قبیل آنالیزهای QSAR/QSPR
نوع: Type: پایان نامه
مقطع: Segment: دکتری
عنوان: Title: رویکردی جدید در انتخاب کاندیدا های دارویی ضد سرطان مبتنی بر روشهای کمومتریکس از قبیل آنالیزهای QSAR/QSPR
ارائه دهنده: Provider: فریدون صادقی
اساتید راهنما: Supervisors: پروفسور عباس افخمی
اساتید مشاور: Advisory Professors: پروفسور طیبه مدرکیان
اساتید ممتحن یا داور: Examining professors or referees: دکتر مهدی هاشمی از دانشگاه بوعلی سینا - پروفسور جهانبخش قاسمی از دانشگاه تهران و پروفسور بهرام همتی نژاد از دانشگاه شیراز
زمان و تاریخ ارائه: Time and date of presentation: شنبه ۱۷ مهر ۱۴۰۰ ساعت ۱۰.۰۰ صبح
مکان ارائه: Place of presentation: آمفی تئاتر پروفسور اردشیر خزائی
چکیده: Abstract: در بخش اول این رساله، یک مطالعه جامع روی مشتقات آنتراسیکلین انجام شد. این ترکیبات آنزیم توپوایزومراز II را که تسهیل کننده تکثیر سلول های سرطانی است، مهار میکنند. روابط کمی ساختار-فعالیت (QSAR) روی ماکزیمم غلظتی از مهارکننده ها که در آن ۵۰ درصد بافت تومور از بین میرود۵۰IC، توسعه یافت. ژنتیک الگوریتم (GA)جهت استخراج دسکریپتورها به کار رفت. رگرسیون خطی چند متغیره مبتنی بر GA برقرار شد. پایداری بالا و قدرت مدل توسط ارزیابی تقاطعی از نوع گذاشتن یکی در بیرون (LOO-CV)، تصادفی کردنY (Y-randomization) و مجموعه تستی خارجی مورد ارزیابی قرار گرفت. این مدل به ۲۹ آنالوگ دیگر با مشاهدات تجربی کمی یا کیفی برون تنی تعمیم یافت و ۵۰pIC آنها محاسبه شد. توافق خوب میان مشاهدات تجربی و ۵۰pIC محاسبه شده، نشان داد که مدل معتبر است. همچنین این نتیجه نشان می دهد که در این آنالوگ ها احتمالاً ویژه بودن ساختار بر ویژه بودن خط سلول سرطانی ارجحیت دارد. علاوه بر این، مدل توسعه یافته به ۴۹ آنالوگ دیگر جهت انتخاب کاندیدا های دارویی مستعد تعمیم یافت. در بخش دوم، در یک بررسی اجمالی، روابط بین فعالیت ۵۰IC، خاصیت logP و ساختار شیمیایی مشتقات آنتراسیکلین ها در نقش مهارکننده های آنزیم توپوایزومراز II به صورت دوبه دو مطالعه شد. این آنالوگ ها در سه دسته با ۵۰IC معلوم، logP معلوم و هردوی ۵۰IC و logP مجهول بررسی شدند. مدل های QSAR و QSPR به ترتیب روی آنالوگ های گروه های اول و دوم توسعه یافت .در برقراری مدل QSPR، نکته جالب توجه مرتبط شدن logP تجربی به ۵۰pIC محاسبه شده بود. جهت ارزیابی بیشتر مدلها اعتبارسنجی خارجی انجام شد؛ بدین منظور logP برای ۷۷ آنالوگ دیگر خارج از مجموعه های آموزشی و تستی محاسبه و با نتایج متناظر از سه برنامه نرم افزاری ClogP،milogP وAlogP مقایسه شد. افزون بر اینها دریافتیم که در مواجهه با آنالوگهای دارای استخلاف کربنی بلندزنجیر (۳ (nc ≥ روشهای تخمین در محاسبه logP خطای قابل توجهی دارند. این در حالیست که مدل پیشنهادی ما نتایج خیلی دقیقتری ارائه میدهد. در بخش سوم، زیرمجموعه جدیدی از ترکیبات پایپریدین جهت توسعه مدل های QSAR به کار رفت. این ترکیبات نه تنها فعالیت مهارکنندگی خوبی روی آنزیم ۱Akt نشان میدهند، بلکه فعالیت ضدتکثیر پذیری آنها به صورت برون تنی علیه دو خط سلول سرطانی روده و تخمدان تایید شده است. بر اساس توصیفگرهای سه بعدی و خود همبستگی دو بعدی انتخاب شده با ژنتیک الگوریتم، رگرسیونهای خطی چند متغیره روی ۵۰IC مربوط به فعالیت ترکیبات در مهار ۱Akt و نیز روی۵۰IC مربوط به خاصیت ضدتکثیر پذیری آنها علیه سلول های سرطانی روده و تخمدان به صورت جداگانه برقرار شد. قدرت، پایداری و قابلیت پیش بینی مدلها با استفاده از اعتبار سنجی خارجی و داخلی ارزیابی شد. علاوه بر این در یک استراتژی جدید هریک از مدلهای GA-MLR ارزیابی شده به دو زیرمجموعه دیگراز مشتقات فوران-پیرازول پایپریدین و تیوفن-پیرازول پایپریدین تعمیم داده شد و فعالیت و شباهت ساختاری این سه زیرمجموعه به طور همزمان باهم مقایسه گردید. در نهایت، متعاقب سنجش های تجربی درون تنی ۱۵ مشتق جدید طراحی و شش تا از آنها به عنوان کاندیدا های دارویی مستعد معرفی شدند تا بررسی های بیشتر روی آنها انجام شود.
آزمون جامع دانشجویان مقطع دکتری دانشکده شیمی و علوم نفت در روز پنج شنبه مورخ 27 / 02 /1403 ساعت 8:00 در محل سالن مطالعه خواهران دانشکده شیمی و علوم نفت برگزار خواهد شد. دانشجویانی...
پژوهشگاه علوم و فناوری اطلاعات ایران کارگاه آموزشی مجازی زنگ ایرانداک را برگزار می نماید. برای کسب اطلاعات بیشتر و ثبت نام در این کارگاه فایل زیر را بارگذاری نمایید. لینک دانلود ...
" به اطلاع دانشجویانی که در نیمسال جاری، واحد سمینار اخذ کرده اند می رساند، طبق مصوبه شورای تحصیلات تکمیلی دانشکده، می بایست حداکثر تا 20 اسفند ۱۴۰۲ موضوع و زمان ارائه سمینار را به کارشناس تحصیلات...
دانشگاه بوعلی سینا در نظر دارد جهت توانمندسازی مهارت زبان انگلیسی دانشجویان مقطع دکتری، دوره بسندگی زبان انگلیسی ویژه این دانشجویان برگزار نماید. لینک بخشنامه جهت اطلاع از شیوه...
ساختمان جدید دانشکده شیمی و علوم نفت با حضور آقای دکتر محمدعلی زلفی گل وزیر محترم علوم، تحقیقات و فناوری و جمعی از مسئولین وزارت عتف و مسئولین استان و دانشگاه در روز پنج شنبه دوازدهم بهمن ماه...
بر اساس آخرین مصوبه، مهلت دفاع از پایان نامه ها هجدهم بهمن ماه سال جاری اعلام گردید. برای دریافت اطلاعیه فایل زیر را دانلود نمایید. لینک دانلود
آیین نامه جدید احراز بسندگی زبان خارجی ویژه دانشجویان مقطع دکتری توسط تحصیلات تکمیلی دانشگاه بوعلی سینا جهت اجرا ابلاغ شد. برای اطلاع از مفاد کامل این آیین نامه فایل زیر را دانلود نمایید. ...
اسامی نهایی برگزیدگان پانزدهمین همایش سالانه آموزشی دفتر هدایت استعداهای درخشان دانشکده شیمی و علوم نفت اعلام گردید. دانشکده شیمی و علوم نفت ضمن عرض تبریک به ایشان، آرزوی...
جناب آقای دکتر سعید عزیزیان، موفقیت شما در کسب عنوان پژوهشگر برتر استان در سال 1402 در بخش علوم پایه را تبریک می‌گوییم و از درگاه خداوند منان توفیق روزافزون و بهروزی شما را خواستاریم . ...
جناب آقای دکتر عباس افخمی، انتخاب جنابعالی به عنوان پژوهشگر برتر کشور در سال 1402 را به جنابعالی تبریک گفته و از درگاه ایزد منان آرزوی توفیقات بیشتر برایتان مسئلت می نماییم. ...
به اطلاع اعضای محترم هیئت علمی و دانشجویان گرامی می‌رساند سخنرانی جناب آقای دکتر صادق صالح‌زاده با موضوع " اخلاق علمی، چرا و چگونه؟ " روز سه‌شنبه 1402/09/14 ساعت ۱۱ در آمفی‌تئاتر دکتر خزایی برگزار...
نمایشگاه پوستر دانشجویی همزمان با نمایشگاه توانمندی های پژوهشی و فناورانه در هفته پژوهش ازتاریخ 11 لغایت 15 آذرماه در دانشکده علوم پایه برگزار خواهد شد. دانشجویان گرامی بایستی پوستر خود را...
با عنایت به تصمیم حوزه معاونت پژوهش و فناوری دانشگاه مبنی بر تقدیر از دانشجویان برتر پژوهشی در هفته پژوهش و فناوری 1402، دانشجویان گرامی می‌توانند فرم و شیوه‌نامه اجرایی انتخاب...
با عنایت به ایین نامه تقدیر از پژوهشگران برتر دانشگاه بوعلی سینا در هفته پژوهش، از کلیه اعضای هیات علمی که واجد شرایط در موارد مطروحه در ماده ۷ آیین نامه انتخاب پژوهشگران برتر دانشگاه...
جناب آقای دکتر آرش قربانی از طرف انجمن شیمی ایران به عنوان شیمیدان برجسته کشور در بخش شیمی آلی انتخاب گردیدند. این انتخاب شایسته را که نشان از تخصص و توانمندی های علمی جناب آقای دکتر قربانی...
به اطلاع دانشجویان گرامی می رساند: کلاس جبرانی آشنایی با پایگاه های اطلاعاتی و منابع علمی در روز دوشنبه مورخ 15 آبان 1402 ساعت 16 در اتاق جلسات دانشکده شیمی و علوم نفت برگزار خواهدشد. لازم به...
آزمون کیوم آبان ماه دانشجویان دانشکده شیمی و علوم نفت دانشگاه بوعلی سینا در تاریخ ۱۴۰۲/۰8/۲3 ساعت ۹ صبح برگزار خواهد شد. جهت اطلاعات بیشتر به صفحه اصلی وب سایت دانشکده شیمی و علوم نفت...
آزمون جامع دانشجویان مقطع دکتری دانشکده شیمی و علوم نفت در روز پنج شنبه مورخه 1402/08/25 ساعت 8:00 صبح در محل آمفی دانشکده برگزار خواهد شد. دانشجویانی که در نیمسال جاری انتخاب...
اردوی فرهنگی و تفریحی ویژه دانشجویان نو ورود دانشگاه بوعلی سینا طی روزهای سوم تا پنجم آبان ماه سال جاری برگزار خواهد شد. دانشجویان گرامی برای دریافت اطلاعات تکمیلی و ثبت نام به سامانه نگارستان...
براساس اطلاعات جدید نمایه استنادی معتبر scopus ۲۰۲۳، با بررسی مقالات مربوط به ۲۰۲۲، ۱۸ نفر از اعضای هیات علمی دانشگاه بوعلی سینا و با بررسی کل مقالات مربوط به سالهای مختلف، ۱۱ نفر از اعضای هیات...